Układ odpornościowy człowieka w taki sam sposób rozpoznaje zarówno białka niechcianych ciał obcych, jak i te w przetaczanej krwi - powoduje to problemy z transfuzją – oraz występujące w przeszczepianych narządach, a także substancje syntetyczne wchodzące w skład urządzeń zastępujących niewydolne narządy. Prowadzi się udane operacje transplantacji (przeszczepów) tkanki tego samego człowieka, np. w przypadku przeniesienia zdrowej skóry w miejsca poparzone. Natomiast wykorzystanie tkanek pochodzących od innej osoby lub od zwierząt mogą spowodować odpowiedź immunologiczną wywołującą odrzucenie przeszczepu, jak i reakcję skierowaną przeciwko gospodarzowi, czyli biorcy przeszczepu.